Skrining Virtual Senyawa Flavonoid sebagai Inhibitor Main Protease untuk Kandidat Anti-Sars-Cov-2

SARS-CoV-2 merupakan virus baru yang ditemukan tahun 2019 di Provinsi Hubei, China. Virus ini telah menyebabkan wabah COVID-19 dengan tingkat kematian 0,5-6%. Setahun setelah COVID-19 ini muncul, belum ditemukan obat pasti dalam penangan terapi, sehingga perlu dilakukan pembuatan dan pengembangan obat baru untuk anti-SARS-CoV-2. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk memprediksi aktivitas senyawa Flavonoid yang dapat digunakan sebagai anti-SARS-CoV-2 dengan metode in silico. Metode in silico yang dipilih yaitu skrining virtual dengan cara prediksi aktivitas antivirus, prediksi druglikeness, prediksi farmakokinetika, prediksi toksisitas, dan simulasi molecular docking. Berdasarkan hasil skrining virtual dari 80 senyawa Flavonoid yang diuji, terdapat 71 senyawa yang diprediksi memiliki aktivitas antivirus, 64 senyawa yang memenuhi aturan Lipinski’s Rule of Five, 56 senyawa diprediksi tidak beresiko toksik dan 15 senyawa yang memiliki profil farmakokinetika yang baik. Sedangkan pada simulasi molecular docking digunakan reseptor target struktur SARS-CoV-2 main protease dengan ID PDB 5RL4, 5R7Y dan 7BUY. Nilai ∆G yang dihasilkan dari re-docking native ligan pada ID PDB 5RL4, 5R7Y dan 7BUY yaitu -8,47 kkal/mol, -6,91 kkal/mol dan -6,49 kkal/mol. Pada simulasi molecular docking terdapat dua senyawa yang memiliki nilai ∆G yang lebih rendah dari native ligan yaitu senyawa Naringin dan rutin. Ketika penambatan dengan ID PDB 5RL4 senyawa Naringin dan Rutin menghasilkan nilai ∆G -10,13 kkal/mol dan -9,57 kkal/mol. Pada penambatan dengan ID PDB 5R7Y menghasilkan -9,84 kkal/mol dan -8,85 kkal/mol. Sedangkan pada penambatan dengan ID PDB 7BUY menghasilkan -9,69 kkal/mol dan -8,97 kkal/mol. Senyawa Naringin dan Rutin memiliki prediksi toksisitas, prediksi aktivitas antivirus dan profil distribusi yang baik.