Skrining Virtual Senyawa Alkaloid sebagai Inhibitor Main Protease untuk Kandidat Anti-SARS-CoV-2

SARS-CoV-2 adalah virus RNA sense positif beruntai tunggal dengan ukuran partikel 120 – 160 nm yang menyerang pernapasan manusia dan menular secara cepat dengan media droplet. SARS-CoV-2 memiliki protein yang digunakan dalam bereplikasi dan menginfeksi salah satunya adalah main protease. Telah dilakukan virtual screening metabolit sekunder alkaloid sebagai anti SARS-CoV-2. Metode yang digunakan berupa analisis senyawa uji dan molecular docking. Dilakukan screening antivirus dimana hasilnya terdapat 56 senyawa yang menunjukan spektrum aktivitas antivirus. Hasil dari analisis fisikokimia menujukan dari 72 senyawa terdapat 54 senyawa yang memenuhi aturan Lipinski’s Rule of Five. Hasil dari prediksi profil farmakokinetik 68 senyawa menunjukan profil farmakokinetik yang baik. Selanjutnya, hasil dari analisis toksisitas memiliki tingkat toksisitas yang aman dimana terbagi menjadi 38 senyawa yang tidak berisiko dan 34 senyawa yang berisiko rendah terhadap tubuh manusia. Selanjutnya, hasil analisis dari molecular docking yang telah dilakukan diketahui bahwa senyawa alkaloid yang terpilih, terutama makaluvamine berpotensi sebagai kandidat senyawa anti-SARS-CoV-2. Pada reseptor main protease (PDB ID: 5RL4) didapatkan 3 senyawa yang memiliki afinitas terbaik yaitu strychnopentamine, emetine dan makaluvamine dengan nilai energi bebas berturut-turut yaitu -10.11 kkal/mol, -9.97 kkal/mol dan -9.81 kkal/mol. Pada reseptor main protease (PDB ID: 7BUY) didapatkan 3 senyawa yang memiliki afinitas terbaik yaitu makaluvamine, emetine dan jozipeltine a dengan nilai energi bebas berturut-turut yaitu -9.62 kkal/mol, -9.56 kkal/mol dan -9.53 kkal/mol. Sedangkan, pada reseptor main protease (PDB ID: 5R7Y) didapatkan 3 senyawa yang memiliki afinitas terbaik yaitu makaluvamine, emetine dan tetrandrine dengan nilai energi bebas berturut – turut yaitu -10.75 kkal/mol, -10.49 kkal/mol dan -10.09 kkal/mol. Hasil dari penelitian ini, makaluvamine dapat dijadikan salah satu kandidat senyawa untuk obat anti-SARS-CoV-2, namun masih memerlukan penelitian lebih lanjut diantaranya molecular dynamic, in vitro dan in vivo.