Pencarian Kandidat Obat Baru sebagai Inhibitor Main Protease SARS-CoV-2 dari Senyawa Aktif Tanaman Glychyrriza glabra: Studi In Silico

Covid-19 menjadi wabah sejak ditemukannya virus SARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2) diakhir tahun 2019 virus ini menyebar ke seluruh dunia dan menjadi pandemi global. Target pengobatan pada Main Protease menjadi harapan baru sebagai jalan keluar wabah ini. Senyawa aktif dari Glycyrrhiza glabra, tanaman yang sudah digunakan sebagai obat sejak 4000 tahun lalu memiliki potensi sebagai kandidat antivirus SARS-CoV-2, dengan melakukan kajian in silico dapat mempercepat penemuan senyawa aktif yang potensial sebagai anti-SARS-CoV-2. Pada penelitian ini dilakukan prediksi aktivitas antivirus, penambatan molekul, molekular dinamik, prediksi druglikeness, hingga prediksi profil farmakokinetika meliputi Absorpsi, distribusi, metabolisme serta profil toksisitas senyawa. Pada penelitian ini juga dilakukan pencarian senyawa simililar berdasarkan kedekatan struktur dari senyawa terbaik untuk memperluas proses pencarian kandidat obat. Kode reseptor main protease yang digunakan yaitu 7NG6, 7SI9, 7DPU dan 7RN4. Sebanyak 112 senyawa uji ditambatkan pada tiap reseptor, dan masing masing reseptor memperoleh tiga senyawa terbaik diantaranya 7NG6 Glycyrrizin (ΔG -9,1 Kkal/mol), Isoliquirtin apioside (ΔG -9,0 kkal/mol) dan Semilicoisoflavone B ΔG -9,0 kkal/mol, selanjutnya pada reseptor 7SI9 senyawa Licoricesaponin E2 (ΔG -10,5 kkal/mol), Glycyrrrhizin (ΔG -10 kkal/mol), dan Licoricesaponin J2 (ΔG-9,5 kkal/mol), pada reseptor ketiga yaitu 7DPU diperoleh senyawa terbaik Licoagrodin (ΔG -8,9 kkal/mol), Naringin (ΔG -8,8 kkal/mol) dan Licoagrone (ΔG -8,5 kkal/mol) dan pada reseptor terakhir dengan kode 7RN4 diperoleh senyawa Semilicoisoflavone B (ΔG -10 kkal/mol), Sophoraisoflavone A (ΔG -9,5 kkal/mol) dan Urarenol (ΔG -9,4 kkal/mol), selanjutnya dilakukan proses molekular dinamik dan prediksi druglikeness dan ADMET, dari keseluruhan proses penelitian didapat satu senyawa yang paling direkomendasikan dan memenuhi parameter uji yaitu senyawa Semilicoisoflavone B dikarenakan setelah dilakukan simulasi dinamika molekuler selama 1ns dengan perangkat lunak Open MM senyawa ini memiliki kestabilan yang terbaik terutama pada reseptor 7NG6 dan 7RN4 dan memenuhi aturan druglikeness sebagai obat oral dan memiliki profil farmakokinetika yang baik.