Simulasi Molecular Docking dan Molecular Dynamic dalam Pencarian Senyawa Aktif Syzygium malaccense (L.) Merr. & L.M. Perry sebagai Antikanker Payudara

Kanker payudara memiliki prevalensi tertinggi dari semua jenis kanker. Kanker payudara telah menjadi penyebab utama insidensi kanker global pada tahun 2020 dengan penambahan jumlah kasus baru sebanyak 2,261,419 kasus atau 11,7% dari total keseluruhan jumlah kasus baru kanker di dunia. Upaya yang dapat dilakukan adalah mencari obat kanker payudara yang aman dan selektif untuk pengobatan dan pencegahan penyakit kanker payudara, salah satunya dari tanaman jambu bol. Jambu bol (Syzygium malaccense (L.) Merr. & L.M. Perry) merupakan salah satu tanaman yang telah banyak diteliti dan terbukti memiliki efek antiproliferatif. Studi farmakofor, simulasi molecular docking, dan simulasi molecular dynamic dilakukan terhadap 155 senyawa aktif jambu bol pada reseptor ER-, ER-, Progesteron, dan HER2. Senyawa rutin berpotensi memiliki aktivitas antikanker payudara yang selektif terhadap reseptor ER- dengan nilai fit score 45,81%. Hasil simulasi molecular docking terhadap ER- dan HER2 diperoleh senyawa rutin dan myricetin diprediksi memiliki aktivitas antikanker payudara dengan nilai energi bebas Gibbs (ΔG) sebesar -10,6kkal/mol dan -10,3kkal/mol lebih baik dibandingkan dengan ligan pembanding Genistein -10,5kkal/mol dan Trastuzumab -7,8kkal/mol dan terikat dengan asam amino esensial pada ARG 346, GLU 305 untuk rutin dan pada residu ASP 863, LYS 753, ALA 751, LEU 796 untuk myricetin. Hasil simulasi molecular dynamic menunjukkan bahwa rutin dan myricetin memiliki kestabilan interaksi pada waktu simulasi yang dijalankan selama 15ns sehingga rutin dan myricetin dapat dijadikan lead compound dan dikembangkan sebagai kandidat antikanker payudara terhadap reseptor ER- dan HER2.