Simulasi Dinamika Molekuler Senyawa Epigallocatechin gallate Terhadap Reseptor KEAP1- NRF2 (Nuclear Factor Erythroid 2) sebagai Terapi Long COVID-19

Infeksi COVID-19 merupakan salah satu pandemi yang menyebabkan angka kematian di seluruh dunia meningkat. Sebagian besar pasien yang menderita COVID-19 biasanya akan pulih dalam waktu 3-4 minggu, namun ada beberapa pasien yang mengalami efek berkelanjutan selama berminggu-minggu atau berbulan-bulan yang disebut dengan long COVID. Salah satu penyebab dari long COVID adalah gangguan ekspresi enzim antioksidan dan protein sitoprotektif yang diatur oleh respon elemen antioksidan terhadap DNA sehingga menyebabkan stress oksifdatif. Dalam hal ini Nuclear Factor Erythroid 2 (NRF2) memiliki peran penting dalam terjadinya long COVID. Epigallocatechin gallate (EGCG) merupakan salah satu senyawa yang berpotensi untuk melawan penyakit yang dimediasi oleh stress oksidatif melalui pengaktifan NRF2 sehingga dapat menghasilkan antioksidan yang bisa menetralkan radikal bebas. Penelitian ini bertujuan untuk melihat afinitas dan kestabilan interaksi ikatan kompleks EGCG dengan NRF2. Studi molecular docking dan molecular dyinamic telah dilakukan terhadap senyawa EGCG dengan hasil nilai energi bebas Gibbs (ΔG) sebesar -11,18 kkal/ dan ligan pembanding Dimethyl Fumarate -4,62 kkal/mol dan terikat dengan asam amino esensial pada SER 508, SER 555 dan SER 363. Hasil simulasi molecular dynamic menunjukkan bahwa EGCG kestabilan interaksi pada waktu simulasi yang dijalankan selama 50 ns berdasarkan parameter Root Mean Square Deviation (RMSD), Root Mean Square Fluctuation (RMSF), nilai Radius of Gyration dan Molecular Mechanics Generalized Surface Area (MM-GBSA) sehingga EGCG berpotensi sebagai pengobatan jangka panjang COVID-19.